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软件安装
如果要顺利运行程序，要求JAVA > 1.7, 以及根据基因组大小而定的内存，一般而言是1M大小的基因对应1GB的内存。
总览
Pilon有如下作用
- 对初步组装进行polish
- 寻找同一物种不同株系间的变异，包括结构变异检测
他以FASTA和BAM文件作为输入，根据比对结果对输入的参考基因组进行提高，包括
- 单碱基差异
- 小的插入缺失(indels)
- 较大的插入缺失或者block替换时间
- 填充参考序列中的N
- 找到局部的错误组装[……]
[…]
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