如何查看显示文件具体某列信息

awk -F ‘\t’ ‘{print $1}’ KO_list_file

note:文件以tab分割列表,$1位第二列

Linux System Administration

Linux System Administration Author: Roc Zhou Date: 21 Aug 2010 This project is goning to move to: New Project Site (http://saunit.sourceforge.net) New Project Blog (http://saunit.sourceforge.net/blog) 基本系统管理 Linux Software RAID 为何使用 Software RAID 安装方案、实现和测试 DNS/Bind9 配置新拿到的域名 为南北双线配置”变态” DNS 南北双线 squid 加速 MySQL Bind 体系结构 文件系统备份和镜像 AA Center, Kerberos AA 基本描述 基本配置和测试 pam_kerb5 login 和 accounts information […]

在亚马逊EC2上部署Apache和Django

EC2是亚马逊(Amazon.com)提供的弹性云计算服务; Apache是一个跨平台的Web服务器端软件,可以使Python、PHP、Perl等语言编写的程序运行在服务器上; Django是一个Web程序框架,应用这个框架,可以使Python Web程序的编写变得更加简单; Amazon S3是亚马逊提供的云存储服务; Amazon EC2与Amazon S3结合, 几乎可以提供无限的存储空间和无限的计算能力。

以上这些东西综合在一起,就可以用简单易用的Python做出一个提供海量数据处理功能的网站,感觉这玩意儿应该在高通量测序数据数据处理方面有点用。

下面是在亚马逊EC2上部署Apache和Django的步骤:

0. 首先需要AWS上在建立一个EC2 Instance,使用Ubuntu Linux系统,可以直接在Community AMI中直接选择Ubuntu官方的AMI,ID为ami-cef405a7,EC2 Instance的建立过程并不复杂,这里就不细说了。注意:建好之后用SSH登录的时候,用户名是ubuntu,不是ec2-user,也不是 root.

1. 安装apache sudo apt-get install apache2

2. 下载安装Django wget http://www.djangoproject.com/download/1.3/tarball/ 下载下来的文件名是index.html,改一下名 mv index.html Django-1.3.tar.gz 解压 tar xzvf Django-1.3.tar.gz 安装 cd Django-0.91 sudo python setup.py install

3. 安装 mod_python apt-get install libapache2-mod-python

4. 重启Apache /etc/init.d/apache2 start

5. […]

linux 增加虚拟内存

mkdir /swaps dd if=/dev/zero of=/swapfile bs=1024 count=20480000 ##20G

mkswap /swaps/1.swap swapon /swaps/1.swap # check state swapon -s

# turn off swapoff # set auto boot

# 随机启动:添加一行到/etc/fstab /swaps/1.swap none swap sw 0 0

Linux下不解压查看压缩文件的内容

1. zcat

可以使用zcat查看gzip压缩后的文件中的内容, 包括tar zcvf命令压缩后的文件

2. tar 可以使用tar -tvf查看tar包中包含的文件

3. zgrep 可以使用zgrep在压缩文件中进行内容搜索,

注:只能查看 .gz 文件.