Good software

multiqc   ranger    ployly https://github.com/MultiQC https://github.com/ranger/ranger https://zhuanlan.zhihu.com/p/34369349 […]

Histograms and Density Plots

Histograms and Density Plots

Histograms

You can create histograms with the function hist(x) where x is a numeric vector of values to be plotted. The option freq=FALSE plots probability densities instead of frequencies. The option breaks= controls the number of bins. # Simple Histogram hist(mtc[......]

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ARGs-OAP: 抗性基因在线分析工具(转)

ARGs_OAP_v2.0(步骤1):https://github.com/biofuture/Ublastx_stageone ARGs-OAP在线分析网站(步骤2): http://smile.hku.hk/SARGs
无处不在的抗性基因

图片.png

环境中抗生素抗性基因(ARGs)的来源: 随机突变或表达潜在抗性基因等方式使细菌体内基因组上存在的抗性基因原型、准抗性基因或潜在抗性基因被表达出来,从而使细菌获得的抗生素抗性。 抗生素在人和动物肠道内诱导产生耐药菌,这些编码ARGs的耐药菌经由粪便排出并进入环境中,是环境中ARGs的重要来源。[……]

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pronunciation

发音第一个 n 带鼻音 analysis    (noun single  ) analyses (noun)  (multiplex number of analysis) 动词 analyse  a’ n(ə)lʌɪz          发音a 不带鼻音 th 在尾巴 发 f thanks 中间ch发k的时候要弱化发音 […]

VOSEQ server start

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[shenzy@LFE0530 VoSeq-2.1.1]$ source /usr/bin/virtualenvwrapper.sh [shenzy@LFE0530 VoSeq-2.1.1]$ workon voseq_environment (voseq_environment) [shenzy@LFE0530 VoSeq-2.1.1]$ python voseq/manage.py runserver –settings=voseq.settings.local 143.89.29.80:8000  

setup environmental[……]

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Sci-Hub 最新可用网址

Pubmedy:显示影响因子+引用数、Sci-hub全文下载的浏览器扩展 很多人都知道一个下载文献的好地方 Sci-Hub,但是现在 Sci-Hub 的站长 Alexandra Elbakyan 女士面临着爱思唯尔的诉讼,让其面临数百万美元的赔偿。因此现在 Sci-Hub 在某些时候可能不可用了。不过 Alexandra Elbakyan 女士并未妥协,希望大家能多支持一下这位女士(貌似只能接受比特币捐款,我也不知道怎么弄,要是paypal或者payoneer就好了)。 相信很多人都知道下面这两个网址: Sci-Hub 官网:http://www.sci-hub.org/[……]

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change the font size of leaf nodes when generating phylogenetic trees using Bio.Phylo.draw()

axes : matplotlib/pylab axes If a valid matplotlib.axes.Axes instance, the phylogram is plotted in that Axes. By default (None), a new figure is created.

This means that you can load your own axes with your size of choice. For example

import matplotlib import matplotlib.pyplot as plt from Bio im[......]

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y叔的ChIP-seq数据分析大礼包(转贴)

熟悉我们生信技能树团队的应该都知道大名鼎鼎的y叔啦,作为我们论坛的荣誉顾问,y叔一直勤勤恳恳的指出我们的错误,特意在此谢谢y叔!并奉上y叔的ChIP-seq数据分析大礼包,已经征得y叔同意啦! 关注Y叔微信公众账号biobabble

CS0: ChIPseq从入门到放弃

接下来要出一个ChIPseq系列,讲一讲ChIPseq和我的ChIPseeker,从入门到放弃是我自己的个人写照。我做ChIPseq总共也就3个月的时间,做的事情并不多,在一知半解的情况下写下了ChIPseeker包。 正如我在《话题投票》里说的,我当时被要求做ChIPseq分析是为他人做嫁衣,而且是[……]

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英文写作检查软件汇总:人工智能帮你写论文,语法检查(转贴)

熬夜写paper的学渣小公举 如果能有一款人工智能 帮我改论文 就好了 …… 没有paper,就没有伤害 我的心愿是 放飞计几,没有paper

3小时前

想太多,呵呵,别做梦了快醒醒 被paper逼疯的三更半夜,你是不是也会发出这样的感叹呢? 别着急,贴心的留学君这就来为大家介绍一些写作(检查、修改)软件:

1.StyleWriter(润色首推) http://www.editorsoftware.com/downloads/DWSWT.html 此软件可嵌入word使用,主[……]

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BACTERIAL GENOMICS TUTORIAL (repost)

[Originally posted by Kat on her BacPathGenomics blog, April 2013] This is a shameless plug for an article and accompanying tutorial I’ve just published together with David Edwards, my excellent MSc Bioinformatics student from the University of Melbourne. It’s currently available as a PDF pre-pub[……]

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