RNA-seq差异表达分析工作流程 (转帖)

之前写过博文《从RNA-seq结果到差异表达》给出了一些关于RNA-seq分析的描述,这篇博文的目的是给出一个示例性质的工作流程。 需要使用到的工具: TopHat Cufflinks Samtools 参考:http://vallandingham.me/RNA_seq_differential_expression.html 首先安装的tophat需要事先安装好bowtie。至于安装方面的问题,这里不至赘述。 整个pipeline非常明确:Sequences → TopHat → Manual Check → Cufflinks → Analysis 第[……]

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