step1:通过mothur 中的summary.seqs 可以很方便获取长度分布信息
mothur > summary.seqs(fasta=AMIgene_11a.pep)
Start End NBases Ambigs Polymer NumSeqs
Minimum: 1 20 20 16 4 1
2.5%-tile: 1 55 55 42 8 35
25%-tile: 1 144 144 112 14 350
Median: 1 242 242 189 17 699
75%-tile: 1 380 380 293 21 1048
97.5%-tile: 1 828 828 646 33 1363
Maximum: 1 2117 2117 1678 48 1397
Mean: 1 288.745 288.745 223.646 17.6886
# of Seqs: 1397
Output File Name:
AMIgene_11a.pep.summary
step2: 利用R 画图 histogram
> setwd("~/public/11a_annotation_work")
> AMIgene_seq.sum <- read.table(file="AMIgene_11a.pep.summary",header=T)
> hist(AMIgene_seq.sum$nbases, col="skyblue", freq=T, xlim=c(0,1500),ylim=c(0,600),xlab="Sequence Length",main="AMIgene Distribution of Sequence Lengths")
Partout, d’Allegrofortissimo au Pulpeclub en passant
par Vive les rondes et Ronde et jolie, on se plaint de la pauvreté de l’offre prêt à porter, on fulmine contre les toiles de
tente informes qui restent trop souvent l’unique choix.
Dans un contexte d’augmentation continue des tailles et des statures environ 10 % de la population française
est obèse, et 20 % en surpoids (1) , la pénurie apparaît d’autant plus criante.La logique des marques, c’est qu’une fille grosse n’a pas envie de s’habiller puisque,
de toute façon, elle est moche, tempête Julie
Exertier, la créatrice de Julie Envy. Jolies rondeurs assumées dans un ensemble jean bustier,
elle raconte son expérience d’ancienne sous traitante.
Carlisle Bay propose 82 chambres confortables qui comprennent des draps italiens
Frette et des articles de toilette de luxe.
Le même problème va se poser avec les internationaux évoluant en Angleterre.
Eux arrêteront le championnat le 13 mai.
Ce qui fait plus de trois semaines à ne rien faire.
Celui qui à lancé les montre connecté c Sony
et c lui seul qui a réussis à faire prendre le marché.
2/ Sprint et traction de poids. 3/ Course en marche arrière et
traction de poids. 4/ Triceps.
La guerre de propagande constante s’est trop souvent avérée être notre Némésis
dans le soutien à la guerre permanente promue par les néo conservateurs et le complexe militaro industriel.A mon avis, donner davantage d’autorité à la poursuite de
la guerre au Moyen Orient est une erreur grave.