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SourceURL:https://muguang.me/it/2757.html Docker + Trojan + Caddy 部署 关于 Trojan，不要多问，问就是代理工具。它先进的地方在于，数据传输使用 TLS 协议，伪装成 HTTPS 请求。Trojan 服务端监听 443 端口，对于普通来路的请求，会交由 Web 服务器处理，返回 Web 网站；而对于 Trojan 客户端来的请求，则由 Trojan 服务端进行代理。这跟 某2ray + Websocket + TLS 原理是一样的，都是通过伪装流量，避免被提取特征或是被检测。 这篇文章里，我将使用 Ubuntu 18.04 操作系统，使用 Caddy 作为 Web 服务器，将 Trojan 服务端和 Caddy 部署到 Docker 中。 0、准备 域名 x1 国外服务器 x1 部署前先给域名设置一条 A 记录，并指向你的服务器 IP。 1、安装 Docker […] [Admin.DESKTOP-7JT504C] ➤ rsync -P –rsh=ssh /drives/d/Kraken_12.tar.gz cityu_jhli_1@172.16.22.11:/BIGDATA1/cityu_jhli_1/mhyleung/database/findfungi Warning: Permanently added ‘172.16.22.11’ (RSA) to the list of known hosts. rsync -P -avz -e “ssh -p5566 -i /drives/C/Users/Admin/Desktop/cityu_jhli_1.id” /drives/d/Kraken_12.tar.gz cityu_jhli_1@172.16.22.11:/BIGDATA1/cityu_jhli_1/mhyleung/database/findfungi [Admin.DESKTOP-7JT504C] ➤ scp -P 5566 -i /drives/C/Users/Admin/Desktop/cityu_jhli_1.id -r /drives/d/Kraken_12.tar.gz cityu_jhli_1@172.16.22.11:/BIGDATA1/cityu_jhli_1/mhyleung/database/findfungi
ssh -p5566 -i /drives/C/Users/Admin/Desktop/cityu_jhli_1.id cityu_jhli_1@172.16.22.11 https://github.com/Jrohy/multi-v2ray
Docker运行 默认创建mkcp + 随机一种伪装头配置文件： docker run -d –name v2ray –privileged –restart always –network host jrohy/v2ray 自定义v2ray配置文件: docker run -d –name v2ray –privileged -v /path/config.json:/etc/v2ray/config.json –restart always –network host jrohy/v2ray 查看v2ray配置: docker exec v2ray bash -c “v2ray info” warning: 如果用centos，需要先关闭防火墙 systemctl stop firewalld.service systemctl disable firewalld.service
> library(gplots) Attaching package: ‘gplots’ The following object is masked from ‘package:stats’: lowess > > setwd(“/home/zyshen/work/QM_nanjing”) > data2<-read.csv(“combined_example.level_5.csv”, header=T, sep=”,”) > data2plot<-data.matrix(data2[2:3]) > row.names(data2plot)<-data2[,1] > heatmap.2(data2plot,trace=”none”,cexCol = 2,col=greenred(50), margins = c(5, 40), sepwidth=c(0.05,0.05))
if (!require(“gplots”)) { install.packages(“gplots”, dependencies = TRUE) library(gplots) } if (!require(“RColorBrewer”)) { install.packages(“RColorBrewer”, dependencies = TRUE) library(RColorBrewer) } […] 扩增子数据分析之多样性指数： alpha多样性 多样性指数（Diversity index）和计算公式可以见： wikipedia Alpha多样性（Alpha Diversity）是对某个样品中物种多样性的分析，包含样品中的物种类别的多样性——丰富度（Richness）和物种组成多少的整体分布——均匀度（Evenness）两个因素，通常用Richness,Chao1，Shannon，Simpson，Dominance和Equitability等指数来评估样本的物种多样性。 丰富度指数 Richness, Chao1，Shannon三个指数是常用的评估丰富度的指标，数值越高表明样品包含的物种丰富度就越高。 Richness指数: 指样本中被检测到的OTU量； Chao1指数 : 通过低丰度OTUs来进一步预测样品中的OTUs数量； Shannon指数 : 计算考虑到样品中的OTUs及其相对丰度信息， 通过对数（如以2为底的shannon_2，以自然对数为底的shannon_e 以10为底的shannon_10）转换来预测样品中的分类多样性。 均匀度指数 Simpson，Dominance和Equitability三个指数是常用的评估均匀度的指标。 Simpson指数 : 表示随机选取两条序列属于同一个分类（如OTUs）的概率（故数值在0~1之间）， 数值越接近1表示表明OTUs的丰度分部越不均匀； Dominancez指数 : 取值为1-Simpson，表示随机选取两条序列属于不同分类（如OTUs）的概率； Equitability指数: 根据Shannon指数值计算，当其值为1时表明样品中的物种丰度分布绝对均匀， 而其值越小这表明物种丰度分布呈现出越高的偏向。 汇总表： 指数 单位 计算方式 richness OTUs 样本中至少包含一条序列的OTU数目 chao1 OTUs N + S^2 / (2D^2)，其中N为OTU个数, S为丰度为1的OTUs个数，D为丰度为2的OTUs数目； shannon_2 bits sum(f), 对所有OTU频率计算p*log(p,2)和, p为OTU的频率； shannon_e nats […] |
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